En mi caso me faltaban algunas partes necesarias de boost. Intente ejecutar en Ubuntu/Debian:
sudo apt-get install libboost-system-dev libboost-filesystem-dev libboost-chrono-dev libboost-program-options-dev libboost-test-dev libboost-thread-dev libboost-iostreams-dev
pensé Lo tenía instalado pero
$ sudo apt-get install libboost1.48-*
me solucionó el problema instalando los paquetes boost faltantes.
En un 64 bits basado en Debian máquina, el siguiente comando me solucionó este error:
./configure --with-boost-libdir=/usr/lib/x86_64-linux-gnu