¿Cómo contar el número de archivos en cada directorio?

Suponiendo que tiene GNU find, deje que busque los directorios y deje que bash haga el resto:

find . -type d -print0 | while read -d '' -r dir; do
    files=("$dir"/*)
    printf "%5d files in directory %s\n" "${#files[@]}" "$dir"
done

find . -type f | cut -d/ -f2 | sort | uniq -c

• find . -type f para encontrar todos los elementos del tipo file , en la carpeta y subcarpetas actuales
• cut -d/ -f2 para recortar su carpeta específica
• sort para ordenar la lista de nombres de carpetas
• uniq -c para devolver el número de veces que se ha contado cada nombre de carpeta

Esto imprime el recuento de archivos por directorio para el nivel de directorio actual:

du -a | cut -d/ -f2 | sort | uniq -c | sort -nr