¿Cómo ejecutar el comando bash con privilegios sudo en Java?

Creo que puedes usar esto, pero dudo un poco en publicarlo. Así que solo diré:

Utilice esto bajo su propio riesgo, no recomendado, no me demande, etc...

public static void main(String[] args) throws IOException {

    String[] cmd = {"/bin/bash","-c","echo password| sudo -S ls"};
    Process pb = Runtime.getRuntime().exec(cmd);

    String line;
    BufferedReader input = new BufferedReader(new InputStreamReader(pb.getInputStream()));
    while ((line = input.readLine()) != null) {
        System.out.println(line);
    }
    input.close();
}

Edite /etc/sudoers con visudo y otorgue a su usuario un derecho NOPASSWD para un script específico:

nombre de usuario ALL=(ALL) NOPASSWD:/opt/yourscript.sh