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¿Alternativa a `memory.size()` de R en Linux?

Creo que esto debe ser manejado por el sistema operativo. No hay un límite incorporado que yo sepa; si es necesario, R usará toda la memoria que pueda obtener.

Para obtener información sobre el total y/o sobre la memoria disponible en linux, puedes probar

system('grep MemTotal /proc/meminfo')

o

system('free -m')

o

system('lshw -class memory')

El último comando se quejará de que debe ejecutar esto como superusuario y le dará una advertencia de que la salida puede no ser precisa; pero según mi experiencia, seguirá proporcionando un resultado bastante útil.

Para obtener información sobre el uso de la memoria de un script R en ejecución, se pueden monitorear los recursos utilizados actualmente iniciando top en una terminal separada, o use, por ejemplo, la siguiente llamada al sistema desde el script R:

system(paste0("cat /proc/",Sys.getpid(),"/status | grep VmSize"))

Espero que esto ayude.


Usando pryr biblioteca:

library("pryr")

mem_used()
# 27.9 MB

x <- mem_used()
x
# 27.9 MB
class(x)
# [1] "bytes"

El resultado es el mismo que la respuesta de @RHertel, con pryr podemos asignar el resultado a una variable.

system('grep MemTotal /proc/meminfo')
# MemTotal:       263844272 kB

Para asignar a una variable con llamada al sistema, use intern = TRUE :

x <- system('grep MemTotal /proc/meminfo', intern = TRUE)
x
# [1] "MemTotal:       263844272 kB"
class(x)
# [1] "character"

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