¿Cómo se cambia el directorio de inicio del usuario en Ubuntu 9.04?

Corriendo

sudo usermod  -d new_home_dir  username

cambiará su directorio de inicio a new_home_dir y también actualizará el archivo del sistema que almacena la ubicación de su directorio de inicio (/etc/passwd ).

Si también desea mover todos los archivos de su directorio de inicio actual, use:

sudo usermod  -d new_home_dir  -m  username

No he probado esto, pero creo que puedes cambiarlo en /etc/passwd.