Es un error de Ubuntu con Chrome 53, así que simplemente actualice a una versión más nueva.
La transparencia del certificado es una forma que tiene Google Chrome (y cualquier otro navegador que decida usarlo) de verificar que un certificado se haya emitido de forma legítima, no de forma incorrecta o malintencionada.
Para un certificado que está marcado como transparencia habilitada (tiene un oid de 1.3.6.1.4.1.11129.2.4.2 en el certificado). Chrome verificará los registros de transparencia del certificado de la autoridad de certificación emisora para asegurarse de que el certificado esté presente.
Sin embargo, algunas autoridades de certificación optan por redactar parte del nombre de dominio en los registros, especialmente para recursos privados.
El escenario más probable aquí es que Namecheap haya solicitado que se eliminen los registros de transparencia para files.namecheap.com en Geotrust (el emisor) y, por lo tanto, Google Chrome no puede verificar que el certificado se haya emitido legítimamente.
Su opción aquí es generar un ticket con Namecheap y ver si pueden emitir un certificado sin redacción y, mientras tanto, agregar una excepción (si está dispuesto a confiar en el certificado).