Solo quería publicar la solución a este problema, en caso de que alguien más se enfrente a un desafío similar.
Agregar el siguiente archivo de reglas funcionó:
/etc/udev/rules.d/90-hide-partitions.rules
KERNEL=="sda2",ENV{UDISKS_PRESENTATION_HIDE}="1"
KERNEL=="sda3",ENV{UDISKS_PRESENTATION_HIDE}="1"
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