Logré reproducir el problema nuevamente y fue el resultado de un gran caché de disco. Las memorias caché de mi disco pueden crecer más de 8 GB y parece que a algunas aplicaciones no les gusta y la E/S sufre.
Eliminando cachés de disco con echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches como raíz soluciona el problema. Actualmente no sé por qué los cachés de disco grandes provocan esta degradación de E/S.
Última actualización: Después de más investigación, descubrí que la cantidad de archivos en el caché estaba provocando el problema. Estaba destruyendo los discos mientras intentaba enviar muchos archivos pequeños al disco. Como estuve usando el sistema durante diez años, me lancé y lo reinstalé con Debian de 64 bits. Ahora está funcionando sin problemas. Probablemente fue un efecto secundario de diez años de actualización al encontrar los límites del sistema operativo de 32 bits.
¿Hay algún mensaje sospechoso en dmesg? ?
Algunas herramientas más que podría probar para obtener información sobre los cuellos de botella de su sistema:
- dstat
- superior de latencia
- prof del sistema