Nvidia aún no es compatible con Wayland, por lo que Fedora 25 recurre a X11. En el foro de Nvidia, veo que alguien ha usado paquetes del Fedora 26 en desarrollo más algunos parches para que funcione, pero señala "Lo probé con compilaciones locales y funciona como una mierda, personalmente no me molestaría probándolo en F25".
Esperemos que esto se resuelva para F26. Mientras tanto, al menos me alegro de que el respaldo de X11 haya funcionado bien y de forma transparente.