Desafortunadamente, no existe una forma oficial de desinstalar CentOS Web Panel. Otros paneles de alojamiento web (como DirectAdmin, VestaCP) tienen desinstaladores pero CWP no tiene uno.
El sitio oficial dice:
CWP no tiene desinstalador, ya que lo está instalando en la "versión mínima de CentOS 6" limpia, modifica completamente su sistema e instala toneladas de paquetes.
La única forma de eliminar CWP es reinstalar su servidor al estado original, como lo tenía antes de la instalación de CWP.
Entonces, la mejor manera es reinstalar su sistema operativo.