Copie la estructura de carpetas (sin archivos) de una ubicación a otra

Podrías hacer algo como:

find . -type d > dirs.txt

para crear la lista de directorios, entonces

xargs mkdir -p < dirs.txt

para crear los directorios en el destino.

cd /path/to/directories &&
find . -type d -exec mkdir -p -- /path/to/backup/{} \;

Aquí hay una solución simple usando rsync:

rsync -av -f"+ */" -f"- *" "$source" "$target"

• una línea
• sin problemas con los espacios
• conservar permisos

Encontré esta solución allí