Falla la redirección de la salida del comando a una variable en bash

Tal vez la salida vaya a stderr , no stdout ? Prueba esto:

OUTPUT=$(sudo apache2ctl configtest 2>&1)

Para la posible situación de nginx cuando la prueba de configuración puede tener éxito con un error en los archivos de configuración. Ejemplo:

nginx: [warn] conflicting server name "test.com" on 0.0.0.0:80, ignored
nginx: the configuration file /etc/nginx/nginx.conf syntax is ok
nginx: configuration file /etc/nginx/nginx.conf test is successful

para corregir los errores de verificación en los scripts de bash, necesita usar:

if [[ $((sudo /sbin/service nginx configtest) 2>&1 | grep "failed\|warn" ) ]]; then
    echo "ERROR!!!"
else
    echo "OK!!!"
fi