¿Cómo evitar el mensaje de advertencia 'son el mismo archivo' cuando se usa cp en Linux?

El problema es que intentas copiar un archivo a sí mismo. Puede evitarlo excluyendo el directorio de destino de los resultados del comando de búsqueda de esta manera:

find "$HOME" -name '*.txt' -type f -not -path "$HOME/newdir/*" -print0 | xargs -0 cp -t "$HOME/newdir" 

intenta usar install en cambio, esto reemplaza eliminando el archivo primero.

install -v target/release/dynnsd-client target/
removed 'target/dynnsd-client'
'target/release/dynnsd-client' -> 'target/dynnsd-client'

y luego elimine los archivos de origen