primero puede verificar el proceso de ejecución de mysql por
ps -ef | grep mysql
luego obtenga la ruta del archivo pid para mysql y elimine el archivo .pid
sudo rm path/to/.pidfile
y luego ejecute el comando
sudo /etc/init.d/mysql stop
esto funcionó para mí.
Mátalo suavemente primero sudo kill 30882 , si no ayuda, mátalo con fuego sudo kill -9 30882 , donde 30882 es pid del proceso mysql.
Tuve el mismo problema. Yo lo hice por primera vez
sudo /etc/init.d/mysql restart
y luego
sudo /etc/init.d/mysql stop
funcionó.