La coincidencia de patrones no funciona en el script bash

Globbing no funciona de esa manera a menos que habilites extglob shell opt. En su lugar, recomiendo usar find :

find . -maxdepth 1 -not -name '<NAME>' -or -name '<NAME>' -delete

antes de ejecutar este comando con -delete asegúrese de que la salida sea correcta

Método con configuración predeterminada y sin procesos externos:

for f in *; do [[ $f =~ ^file[12]$ ]] || echo "$f"; done

La sintaxis global extendida que intenta usar está desactivada de forma predeterminada; tienes que habilitarlo por separado en cada script donde quieras usarlo.

shopt -s extglob

Los scripts no deben usar ls aunque me imagino que lo estabas usando simplemente como un marcador de posición aquí.