Prueba el --proxy-server opción de línea de comando, y/o http_proxy variable de entorno.
google-chrome-stable --proxy-server="http://example.com:8080"
Además, Chrome/Chromium utiliza secuencias de comandos xdg, por lo que puede intentar configurar el servidor proxy en GNOME/KDE y configurar las secuencias de comandos xdg para usar la configuración del entorno de escritorio. Así es como resolví al menos las asociaciones de archivos de tipo MIME.
ejecuta esto como root gedit /usr/share/applications/google-chrome.desktop luego agregue su configuración de proxy como le gustaría, es decir, --proxy-server="http://127.0.0.1:8080" luego guarde y ejecute Chrome.
En Ubuntu 16.04 LTS con Chrome v53 (64 bits), tuve que configurar las variables de entorno http_proxy/HTTP_PROXY en "http://proxyserver:port" para todos los usuarios para que Chrome pueda comunicarse.
Modificar /etc/perfil
export {http,ftp,https,rsync}_proxy="http://proxyserver:port"
export {HTTP,FTP,HTTPS,RSYNC}_PROXY=$http_proxy