Simplemente especifique la ruta al script. No es necesario cd :
0 12 * * * /path/to/script args
Si su secuencia de comandos busca archivos en . , entonces podrás tiene que usar cd :
0 12 * * * cd /some/dir && /path/to/script args
Tu pregunta tiene poco sentido. Usa cd . Si pides la respuesta no usar cd porque lo probaste y no funcionó, es probable que no lo hayas ingresado correctamente en el crontab.
La forma más sencilla sería escribir un pequeño script de shell que cd y ejecute su tarea principal, luego cronifique el script.