Se puede usar para mostrar los registros de la CPU (que podrían contener bits de información confidencial), desmontar sistemas de archivos a la fuerza o reiniciar la computadora, entre otras cosas (vulnerabilidad de denegación de servicio).
Aunque no diría que es peligroso. Si tiene acceso físico al servidor, puede hacer tantas cosas sin siquiera usar la tecla "mágica". Muchas distribuciones, por ejemplo, permiten reiniciar el servidor con Ctrl +Alt +Supr sin iniciar sesión, pero incluso si está desactivado, simplemente desconecte el cable de alimentación.
Una vez que un atacante tiene acceso físico, todas las apuestas están canceladas.