Vaya a configuración (F2), en Medidores, seleccione lo que está en la columna de la izquierda y lo que está en la columna de la derecha. En lugar de CPU (1/1) en la columna de la izquierda, seleccione CPU (1/2) para la columna de la izquierda y CPU (2/2) para la columna de la derecha. F10 para guardar los cambios y listo.
Como respondí a esta versión más reciente de la misma pregunta, este problema también puede ocurrir cuando usa una versión de htoprc que ha sido optimizada para una computadora con menos CPU. Esto sucede cuando usa LDAP o algún otro sistema para compartir su carpeta de inicio entre computadoras.
Puedes solucionar esto eliminando .config/htop/htoprc e iniciar htop en la computadora con la mayor cantidad de núcleos de la que usa. Esto escribirá un archivo htoprc optimizado para muchos núcleos (es decir, con cuatro columnas para CPU).
Para obtener más detalles, visite mi respuesta sobre la otra pregunta que vinculé anteriormente.