Necesita algo que sondee los cambios de archivos porque si un archivo se modifica en el lado de Windows, el kernel de Linux no lo sabrá. Hay algunas aplicaciones existentes que pueden ayudar con eso, como Guard:http://guardgem.org/
Dependiendo de sus necesidades exactas, podría simplemente watch
la lista de archivos (ajustando n segundos a lo que sea adecuado):
watch --differences -n 10 ls -l </path/to/shared/dir>