No ejecute el trabajo cron si ya se está ejecutando

Solución 1:

Use un script bash como su trabajo cron

cron.sh

#!/bin/bash
$lockfile=/tmp/lock.file

if [ ! -e $lockfile ]; then
   touch $lockfile
   php /path/to/php/script.php
   rm $lockfile
else
   echo "script already running"
fi

Solución 2:

Consulte Gestión de procesos. Probablemente querrá usar un archivo de bloqueo. Puedes usar flock por ejemplo.

¿Por qué no puedes dejar que tus trabajos se completen?

Sus preguntas dicen "O no entendí la respuesta o no se aplica a mí", pero no dice de qué manera. Sea más específico.