Cómo escanear múltiples directorios con clamav

Solución 1:

Tienes que poner la lista de carpetas/archivos en un archivo de texto y pasarlo a clamscan usando -f.

Ejemplo:
clamscan -r -z -i --bell --file-list=/home/nav/ClamScanTheseFolders.txt

Solución 2:

DIRTOSCAN="/home /var/spool /bin /sbin";
for S in ${DIRTOSCAN}; do
  clamscan -ri "$S" >> "$LOGFILE";
done

Crédito:https://www.howtoforge.com/tutorial/configure-clamav-to-scan-and-notify-virus-and-malware/