Si se trata de un directorio grande, es posible que desee considerar ejecutarlo con varios procesadores:
find . -type f -print0 | xargs -0 -n 1 -P 4 dos2unix
Esto pasará 1 archivo a la vez y usará 4 procesadores.
find . -type f -print0 | xargs -0 dos2unix
Encontrará recursivamente todos los archivos dentro del directorio actual y solicitará estos archivos comando dos2unix