service mysqld restart
Simplemente reiniciar mysqld me funcionó en Centos.
Tuve este problema con mi servidor OTRS después de intentar actualizar un paquete grande.
La solución fue:
copia por seguridad:
cp /var/lock/subsys/mysqld /root/mysqld
que borrarlo
rm /var/lock/subsys/mysqld
que cerrar todos los servicios que dependen de mysql:
service httpd stop
service otrs stop
después de eso:
service mysqld restart
service httpd restart
service otrs restart
El sistema es CentOS 6.x
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