du -x no atravesará ningún punto de montaje que encuentre. Pero si se le dice que empezar en un punto de montaje, entonces hará lo solicitado.
Esto es raro, pero parece hacer lo que quieres, desde el shell,
for d in /*; do egrep " ${d} " /proc/mounts > /dev/null || du -sh ${d}; done
Agrega un sudo frente al du si es necesario.