Eche un vistazo a ¿Cómo evitar que Ubuntu cree una carpeta .Trash-1000 al eliminar archivos de una unidad flash USB?
Según el artículo, Ubuntu creará dichas carpetas cuando se elimine un archivo de una unidad USB. Presumiblemente, esto permitiría restaurar un archivo si lo elimina accidentalmente.
En cualquier caso, el artículo ofrece las siguientes recomendaciones para evitar que se cree una carpeta Papelera:
No use solo el botón Eliminar (de lo contrario, se creará la carpeta .Trash-1000)
Presione la combinación de teclas shift+delete para eliminar y luego Ubuntu no creará una carpeta .Trash-1000. (Nota:¡Si elimina archivos y carpetas de esta manera, desaparecerán para siempre!)
Para cada punto de montaje, Ubuntu crea una "papelera" tan pronto como elimina un archivo, por lo que el archivo se puede recuperar más tarde.
El 1000 es el UID del usuario que creó el contenedor, por lo que cada usuario puede tener el suyo propio.