¿Cómo enumero los procesos en htop solo por su nombre, sin la ruta completa?

Aparentemente no. Sin embargo, puede ir a Configuración/DisplayItems para resaltar los nombres base.

No solo enumera el comando como desea, sino que al menos lo hace un poco más visible.

Como actualización, ahora aparentemente hay una opción en Configuración/DisplayItems Show Program Path que está marcada por defecto. Solo necesita desmarcar eso para que solo se muestre el nombre del comando.

Para hacer que htop muestre solo procesos nginx:

htop -p $(pgrep nginx | paste -s -d,)