Añadir:
changeps1: False
a su archivo .condarc.
http://conda.pydata.org/docs/config.html#change-command-prompt-changeps1
He tenido un problema ligeramente diferente, pero relacionado:cómo evitar que el env base se active de forma predeterminada para cada ventana de terminal. Solución:
conda config --set auto_activate_base False
Nota:esto solo funciona si ha ejecutado conda init primero.
Ejecute esto en la terminal:
$ conda config --set changeps1 False
http://conda.pydata.org/docs/config.html#change-command-prompt-changeps1