Un enfoque sería convertir primero ambos archivos XML en XML canónico y comparar los resultados usando diff . Por ejemplo, xmllint se puede usar para canonicalizar XML.
$ xmllint --c14n one.xml > 1.xml
$ xmllint --c14n two.xml > 2.xml
$ diff 1.xml 2.xml
O como una sola línea.
$ diff <(xmllint --c14n one.xml) <(xmllint --c14n two.xml)
La respuesta de Jukka no funcionó para mí, pero apuntó a XML canónico. Ninguno --c14n ni --c14n11 ordené los atributos, pero encontré el --exc-c14n switch ordenó los atributos. --exc-c14n no aparece en la página del manual, pero se describe en la línea de comandos como "formato canónico exclusivo de W3C".
$ xmllint --exc-c14n one.xml > 1.xml
$ xmllint --exc-c14n two.xml > 2.xml
$ diff 1.xml 2.xml
$ xmllint | grep c14
--c14n : save in W3C canonical format v1.0 (with comments)
--c14n11 : save in W3C canonical format v1.1 (with comments)
--exc-c14n : save in W3C exclusive canonical format (with comments)
$ rpm -qf /usr/bin/xmllint
libxml2-2.7.6-14.el6.x86_64
libxml2-2.7.6-14.el6.i686
$ cat /etc/system-release
CentOS release 6.5 (Final)
Advertencia --exc-c14n elimina el encabezado xml mientras que --c14n antepone el encabezado xml si no está allí.
Intenté usar la respuesta de @Jukka Matilainen, pero tuve problemas con los espacios en blanco (uno de los archivos era una gran línea). Usar --format ayuda a omitir las diferencias de espacios en blanco.
xmllint --format one.xml > 1.xml
xmllint --format two.xml > 2.xml
diff 1.xml 2.xml
Nota:Usa vimdiff comando para la comparación lado a lado de los xmls.