Creo que el problema que está teniendo es que simplemente NO hay un esquema de partición en el disco.
Lo que quizás no se dé cuenta es que Linux le permitirá tratar todo el disco como un dispositivo de bloque, es decir, una sola partición grande, y toda la información que ha proporcionado parece apuntar a este tipo de configuración. Creo que Windows no admitirá un dispositivo de bloque sin formato.
La forma típica de solucionar este problema sería copiar los datos en otro lugar, particionar y luego formatear el disco (usando FAT o NTFS o algún tipo de sistema de archivos que tanto Windows como Linux puedan leer) y luego volver a copiar los datos. Si es posible hacer todo este proceso sin mover los datos del disco, es un alto riesgo, y realmente debería hacer una copia de seguridad de los datos primero de todos modos, volviendo al punto de partida.