Con bind 9.9, "rndc sync" no es suficiente; también necesita el indicador "-clean":
sincronizar [-limpiar ] [zona [clase [vista]]]Sincronizar los cambios en el archivo de diario para una zona dinámica con el archivo maestro. Si se especifica la opción "-clean", el archivo de diario también se elimina. Si no se especifica ninguna zona, todas las zonas se sincronizan.
He mirado esto antes.
Reiniciando named eliminará los datos actualizados de .jnl archivos de vuelta al archivo de zona, pero también hay otra forma...
rndc freeze <zone> pero esto deshabilitará DDNS, por lo que debe seguirse con un rndc thaw <zone> para volver a habilitarlo, y debería borrar el .jnl archivos
Aparentemente hay un rndc sync en Bind 9.9.